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孩子個子矮的原因很多，首先我們看一下非內分泌方面的原因。非內分泌缺陷性的矮身材，比如說家族性特發性矮身材、體質性青春發育期延遲、營養不良性矮身材。還有一個就是生長激素缺乏，比如說孩子垂體發育異常、前腦無裂畸形、下丘腦錯構瘤等等，還有生長激素釋放激素缺陷、特發性生長激素缺乏癥，甚至有些是機理不明的。部分可見垂體發育不良，包括常染色體隱性遺傳、顯性遺傳，還有X連鎖遺傳，還有一些是轉錄因子、基因缺陷。生長激素受體缺陷，有一些是胰島素樣生長因子-1缺乏。還有一個是顱腦損傷，比如圍產期損傷，如臀位產、缺血缺氧、顱內出血，顱底骨折，放射性損傷，炎癥后遺癥等。比如說腫瘤，還有小于胎齡兒、生長激素及神經分泌功能障礙、精神心理性矮身材、染色體疾病，還有慢性系統性疾病等等。