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骨髓增生異常綜合征的鑒別診斷如下： 1、巨幼細胞性貧血，可引起血細胞異常發育，表現為大細胞貧血，可造成三系減少。所以需要檢查維生素B12、葉酸。MDS患者維生素B12及葉酸含量一般不會減低，有時呈升高趨勢； 2、接受細胞毒性藥物或細胞因子治療導致的血細胞減少情況； 3、接觸血液毒性化學制品或生物制劑導致的血細胞減少情況； 4、感染或非感染性炎癥； 5、腫瘤引起的慢性病的貧血、慢性肝病或HIV感染； 6、自身免疫性血細胞減少； 7、甲狀腺功能減退； 8、重金屬中毒、過度飲酒所致的血細胞的下降； 9、其它可累及造血干細胞的疾病，如再生障礙性貧血、陣發性睡眠性血紅蛋白尿、大顆粒淋巴細胞白血病等。