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HPV11型陽性不一定是尖銳濕疣，但絕大部分的HPV11型陽性，尤其是外生殖器部位的HPV11型陽性，就是尖銳濕疣。HPV的臨床亞型較多，有上百種的臨床亞型，尖銳濕疣常見的亞型是6型、11型、16型和18型。HPV11型主要的存在部位，是尖銳濕疣的皮疹部位。除尖銳濕疣的皮疹部位外，在其他部位，例如咽喉部位的乳頭狀瘤、結膜部位的乳頭狀瘤，也有可能會存在HPV11型陽性。所以HPV11型陽性的標本檢測，其取材來源于外生殖器部位的疣狀皮疹，就可明確為尖銳濕疣。如果HPV11型陽性的取材來源于咽喉部位，或者來源于結膜部位，可能是咽喉部位或者結膜部位的乳頭狀瘤，而不考慮尖銳濕疣。所以HPV的取材來源不同，臨床診斷不一樣。尖銳濕疣是外生殖器部位的HPV感染，主要在外生殖器部位有疣體存在，同時取材證實是HPV11型陽性，這個部位的疣體是尖銳濕疣。而其他非外生殖器部位，則不能診斷為尖銳濕疣。