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硒酵母對橋本氏甲狀腺炎有輔助作用，但不作為橋本氏甲狀腺炎必須使用的藥物。硒酵母主要成分是硒元素，硒在體內主要是以硒代半胱氨酸的形式存在于硒蛋白當中，硒蛋白與甲狀腺之間有一定關系。有一種在甲狀腺合成代謝的特殊酶，叫碘甲狀腺原氨酸脫碘酶，這個酶就需要硒蛋白參與。硒酵母使用以后，對橋本氏甲狀腺炎有一定的降低甲狀腺自身抗體的作用，包括甲狀腺球蛋白抗體和甲狀腺微粒體抗體。但是有些人有比較明顯的作用，有些人使用以后抗體變化并不大，因為存在著個體差異，而且使用硒酵母降低了甲狀腺自身抗體、橋本氏甲狀腺炎自身抗體，但是對于甲狀腺功能的保護并沒有起到明顯的作用。因此如果甲狀腺功能正常，通常不需要進行特別的藥物治療，如果吃硒酵母也不作為主要治療方法。