苦蕎茶對人體有多種保健功效，一般情況下，大多數人飲用都無副作用，但要注意個別特殊的情況。

1、低血糖人士慎喝。苦蕎茶有顯著的健胃消食功效，所以應在飯后飲用。如果飲用者處于饑餓狀態，腹中已經沒有食物的時候再大量喝苦蕎茶的話，肯定會加重饑餓感，特別是低血糖人士，此時會出現血糖下降的不適癥狀，因此需要特別注意。

2、過量會出現反酸、腹瀉。苦蕎可以輔助調節胃酸過多癥狀，但苦蕎偏寒性，所以胃寒或者有胃病的人群過多食用，會造成反酸腹瀉的現象。

3、皮膚瘙癢、頭暈、哮喘等過敏癥狀。少部分人群食用蕎麥食品后會引起皮膚搔癢、頭暈、哮喘等過敏癥狀，所以黑苦蕎過敏史者謹慎食用。

4、低血壓人群慎用。苦蕎莖、葉、花、果天然原料中自身所含蘆丁，可能有降血壓、降血糖、降血脂作用，低血壓、低血糖及嚴重體型瘦弱病人請謹慎食用。