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分枝桿菌包括結核分枝桿菌復合群、麻風分枝桿菌、非結核分枝桿菌。結核分枝桿菌復合群主要包括人型結核分枝桿菌、牛型分枝桿菌、鼠型分枝桿菌、非洲型分枝桿菌。 其中人型、牛型和非洲型為人類致病菌，鼠型分枝桿菌不引起人類的結核病，主要引起鼠類的結核病。人類感染的結核90%以上為人型結核分枝桿菌所致，牛型分枝桿菌主要引起牛的結核病，但同時也可引起人類的結核病，但所占臨床比例較小。