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細菌性痢疾是由志賀桿菌引起，一般主要包括4個菌，即痢疾志賀菌、福氏志賀菌、宋內志賀菌、鮑氏志賀菌。我國主要流行的是福氏志賀菌和宋內志賀菌。福氏志賀菌引起的痢疾，一般臨床癥狀相對宋內志賀菌要略重，另外容易引起慢性的細菌性痢疾。而宋內志賀菌引起的痢疾病情一般相對比較輕，引起慢性痢疾的相對比較少。我國既往主要流行的是這2個志賀菌引起的痢疾，最早是以福氏志賀菌為主，宋內志賀菌相對比較少。但最近這些年隨著我國衛生條件的改善，這2個菌現在出現了互換位置。目前主要的是宋內志賀菌，福氏志賀菌引起的痢疾相對來說在逐漸減少。宋內志賀菌引起的痢疾病情相對表現比較輕，引起慢性痢疾的相對比較少。目前我國臨床發現的痢疾并不是非常典型，主要就是癥狀表現期，沒有典型的膿血便、腹痛以及里急后重這些典型的痢疾癥狀。而癥狀相對比較輕，病程相對會明顯縮短，引起慢性痢疾相對也比較少。主要是由于我國痢疾志賀菌發生了菌群的變化，主要以宋內志賀菌群為主。