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自身免疫性腦炎是自身免疫介導的腦炎。人有自身免疫的系統，正常的自身免疫系統可以抵御外來的侵略，比如外來病毒、細菌的侵入，通過免疫系統可以把這部分感染清除，但是當自身免疫系統出現異常，就會產生對自身組織的抗體。自身免疫性腦炎就是產生了對自身腦組織的特異性抗體，因為這些抗體的產生，從而使自身免疫系統來攻擊腦組織，造成腦組織的損害，從而產生炎癥性的反應。 自身免疫性腦炎有相當一部分病人并不能找到明確的原因，但是部分病人發現和腫瘤相關，有些腫瘤，比如畸胎瘤、小細胞肺癌等都可以誘發自身免疫性腦炎。醫學上把這部分情況叫副腫瘤綜合征的一種表現，病人會出現精神行為的異常、認知的損害、語言的障礙以及肢體活動的障礙。