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患者幽門螺桿菌檢查陰性，表示通過檢查方法目前沒有檢測到幽門螺桿菌感染。臨床上檢查幽門螺桿菌方法較多，多數是定性檢查，檢查結果描述為陰性或者陽性，每種檢查都存在一定敏感性和特異性，可能存在假陽性或假陰性情況，因此需要不同檢查方法綜合判斷。幽門螺桿菌檢查常用的無創方法，包括C-13或C-14呼氣試驗，以及大便查幽門螺桿菌抗原，還可通過抽血檢測幽門螺桿菌抗體。患者在做胃鏡檢查的同時，可以通過在胃鏡下取一塊胃黏膜組織，用快速尿素酶方法進行幽門螺桿菌判斷，如果變色指示劑顏色發生改變，則為陽性；如果沒有改變可能是陰性。