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胃腸道間質瘤大部分發生在胃和小腸，目前胃腸道間質瘤還沒有發現確切的病因，臨床上認為其發病可能和環境因素有關，比如與病毒、射線、污染物等因素有關。最新研究認為胃腸道間質瘤的發生跟基因突變有關，認為胃腸道間質瘤的始發原因是由于C-kit基因突變引起。C-kit基因突變導致這種基因表達的蛋白大量擴增，從而引起胃間質組織瘤性改變和無限期的繁殖，形成一種腫瘤。 胃腸道間質瘤是胃腸道最常見的間葉源性腫瘤，占胃腸道惡性腫瘤的1%-3%，多見于中老年人。在生活中就要對可能引起胃腸道間質瘤的相關因素多加關注，并遠離因素，從而保護自己。