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HLA-B27陰性代表被檢測者細胞沒有表達HLA-B27基因，HLA-B27基因代表人白細胞抗原B27，是主要組織相容性復合體Ⅰ類基因，主要表達在機體的有核細胞上，尤其是淋巴細胞表面。HLA-B27的表達與強直性脊柱炎有關，強直性脊柱炎90%的患者HLA-B27基因是陽性表達，一般人群中，HLA-B27陽性的患者患強直性脊柱炎的比例比陰性人群高。HLA-B27的亞型較多，與強直性脊柱炎相關的亞型主要有HLAB2704和HLA-B2705，HLA-B27陽性的健康人與強直性脊柱炎患者可能有遺傳差異，所以HLA-B27陽性只代表遺傳了基因，不代表患有強直性脊柱炎。HLA-B27陰性的患者，也不能完全排除患有強直性脊柱炎的可能。