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HLA-B27陰性代表機體并不表達HLA-B27基因，HLA-B27代表的是人類癌細胞抗原B27的簡稱。HLA-B27這個基因屬于一型主要組織相容復合體基因，這個基因基本上表達機體所有的有核細胞上，尤其是在淋巴細胞表面。HLA-B27的表達和強直性脊柱炎有密切關系，在強直性脊柱炎患者當中，90%左右的患者HLA-B27為陽性，在一般人群當中，HLA陽性的患者患強直性脊柱炎的幾率要比陰性的人群明顯的增加，也就是HLA-B27如果陰性，其患強直性脊柱炎的可能性會明顯下降。目前已經發現HLA-B27有很多的亞型，而和強直性脊柱炎相關的主要是HLA-B2704，和HLA-B2705，HLA-B27陽性的健康者和強直性脊柱炎患者可能有一些遺傳差異，所以HLA-B27陽性的患者，僅代表遺傳和表達的基因，并不一定就說明患有強直性脊柱炎。同樣對于HLA-B27陰性的人群，并不是代表就不會得強直性脊柱炎這個疾病，也有可能存在一些，HLA-B27陰性的強直性脊柱炎人群。