(2)糞便常規肉眼外觀，如便標本中肉眼可見黏液和血便，提示是一個炎癥過程。顯微鏡下檢查：見紅、白細胞可提示炎癥性腹瀉;暗視野下見“魚群樣運動”提示弧菌，并需進行制動試驗以甄別霍亂弧菌;如腹瀉帶血，尤其糞便中不含白細胞，提示可能為出血性大腸桿菌EHEC(O157:H7/O104:H4)或阿米巴、艱難梭菌感染(后兩種病原體可破壞糞便中的白細胞)。

(3)諾如和輪狀等病毒性腹瀉可用ELISA法檢測抗原或RT-PCR檢測病毒核酸。

(4)寄生蟲如懷疑寄生蟲感染可選擇便涂片找蟲卵或卵囊。

2、血常規

炎癥性腹瀉患者外周血白細胞總數和中性分類可增高。合并溶血尿毒綜合征(HUS)時有貧血及血小板減少。